На этот раз неугомонная Лара Крофт получает особое задание от английского спецподразделения. Девушке предстоит отправиться на поиски Ящика Пандоры, древнейший артефакт из античных мифов, в котором находится особая разновидность чумы, способная за короткое время уничтожить все живое на Земле. Но помимо Лары Крофт за Ящиком Пандоры также начинает охоту Джонатан Рейсс, знаменитый ученый, получивший Нобелевскую премию, а в итоге ставший биотеррористом. Ключ к поискам древнего артефакта хранится в Колыбели Жизни, магическом священном шаре. Ларе удается найти Колыбель в затонувшем Храме Луны. Однако известному преступнику Чену Ло удается опередить Лару и похитить Колыбель, чтобы продать ее Джонатану Рейссу.