Сюжет мультфильма повествует о Балто, отважной и преданной собаке, в которой все еще течет волчья кровь. У Балто появились детки. Он постарался, чтобы его щенки попали в хорошие руки. Но одна девочка по имени Алю внезапно для себя начинает понимать, что не может стать такой как ее братья и сестры. Она поняла это, когда однажды в лесу встретила охотника, и вдруг ощутила внутри себя пробуждение дикой природы. Но кто, же она на самом деле - собака или волк? Для того чтобы разобраться в этом, она отправляется в долгое путешествие по широким просторам ледяной Аляски, где Балто, любящий отец, ни на шаг не отойдет от нее.